Compilar java

Para compilar desde la consola en Ubuntu se usa:
$ javac programa.java
una vez compilado se crea un programa .class para ejecutarlo:
$ java programa
y listo ;)
Para que funcione adecuadamente el entorno de programación eclipse se requiere instalar "easy eclipse" desde el centro de software.
Para ejecutar un .jar desde consola:
$ java -jar mi-paquete-a-ejecutar.jar
para Definir el programa para abrir programas Java:
Basta con hacer click con el botón derecho sobre un fichero .jar y seleccionar "Abrir con otra aplicación" y escribir "java -jar " ojo dejar el espacio en blanco después de jar.